Sean Patrick Flanery (Lake Charles, Louisiana, 11 de Outubro de 1965) é um ator estadunidense, mais conhecido por seu papel em The Boondock Saints e The Boondock Saints II: All Saints Day como Connor McManus, e pelo seriado The Young Indiana Jones Chronicles, onde ele interpreta o protagonista.
Flanery cresceu em Houston, mas para perseguir a carreira de ator, teve que se mudar para Los Angeles ainda cedo. Desde 1988, ele fez participações em mais de 53 filmes incluindo The Boondock Saints, Powder, Simply Irresistible e D-Tox. A partir de 2002, ele passou a participar do seriado The Dead Zone, como Greg Stilson.