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Peter Charles Doherty (Brisbane, 15 de outubro de 1940) é um médico veterinário, imunologista e professor australiano. Foi agraciado com o Nobel de Fisiologia ou Medicina de 1996.
Ele recebeu o Prêmio Albert Lasker de Pesquisa Médica Básica em 1995, o Prêmio Nobel de Fisiologia ou Medicina juntamente com Rolf M. Zinkernagel em 1996 e foi nomeado Australiano do Ano em 1997. Na Austrália Dia de honra de 1997, ele foi nomeado Companheiro da Ordem da Austrália por seu trabalho com Zinkernagel. Em 2009, como parte das celebrações do Q150, a pesquisa do sistema imunológico de Doherty foi anunciada como um dos ícones do Q150 de Queensland por seu papel de icônico "inovação e invenção".